药物可以影响该阶段胎儿的大脑、神经系统、外生殖器官的发育。孕妇在怀孕的最后1周用药应特别注意，因为某些药物在胎儿中于分娩时会产生严重的不良反应，而且胎儿成为新生婴儿时，必须完全承担药物代谢和消除的负担。但此时婴儿的不完善代谢系统还不能迅速而有效地处理和消除药物，所以药物可在婴儿体内蓄积并产生药物过量的表现。对于早产儿，其代谢作用更不成熟，危险性就会更大。

　　完全避免使用的药物：

　　促进蛋白质合成的药物（男性激素样药品物可增加食欲和体重）、口服抗凝剂、阿司匹林（长期或大剂量使用）、氯霉素、己烯雌酚、碘化物类、烟碱（烟草）、呋喃妥因、口服降血糖药物（服用33周以后）、性激素（任何种类）、磺胺类、四环素类。

　　遵医嘱使用的药物：

　　苯丙胺类、强镇痛药、麻醉药品、制酸药（含钠离子）、抗甲状腺药、巴比妥酸盐类、溴化物、卡马西平、氯喹、多粘菌素E、可的松样药物、环磷酰胺、麦角胺、卡那霉素、轻泻药、锂、萘啶酸、麻醉药品、去甲阿密替林、吩噻嗪类、苯妥英、扑痫酮、普萘洛尔、丙基硫尿嘧啶、奎尼丁、奎宁、利血平、链霉素、紫霉素、维生素C（大剂量）、维生素K（合成品）。